Lamia Benamara

Mardi 29 novembre 2011 à 11h, en salle 25-26 / 105

Les graphes de terrain apparaissent dans de nombreux contextes : réseaux informatiques, réseaux biologiques, réseaux sociaux, graphes issus du web, etc. Jusqu’à récemment ces objets étaient principalement étudiés sous un angle statique. Or, la plupart de ces graphes sont en réalité des graphes dynamiques. Cette dynamique peut apparaître d’une façon différente selon les contextes : réseaux sociaux dans lesquels des connexions entre individus apparaissent et disparaissent au cours du temps, graphes du web dans lesquels des pages sont créées ou supprimées, etc. Un grand nombre de résultats de ces 10 dernières années ont introduit un ensemble d’outils pour l’analyse et la description des graphes statiques, mais peu a été fait pour l’étude de leur dynamique. Nous avons abordé dans cette thèse la problématique de la caractérisation de la dynamique des graphes de terrain tout en prenant en compte le biais lié à la mesure, en nous appuyant sur des cas concrets de graphes dynamiques. Nos contributions se sont orientées dans deux directions. Nous nous somme tout d’abord intéressés à l’étude du biais dans l’observation de la dynamique induit par le fait que la période d’observation est finie. Nous avons proposé une nouvelle méthodologie qui permet de déterminer si la longueur de la période d’observation est suffisante pour une caractérisation rigoureuse d’une propriété donnée. Cette méthodologie est générique et peut être appliquée à n’importe quelle propriété caractérisant un graphe de terrain dynamique. Pour démontrer la pertinence de notre méthodologie, nous l’avons appliquée à l’étude de différentes propriétés dans un système P2P. Notre deuxième contribution consiste en une approche pour étudier des graphes dynamiques. Nous avons cherché à la fois à caractériser la dynamique globale de ces systèmes, et à identifier les éventuels nÅ“uds ayant un comportement particulier. Nous avons étudié plusieurs jeux de données issus de réseaux de contacts entre personnes et nous avons montré que chaque jeu de données a ses particularités. Nous avons également constaté que certaines caractéristiques sont partagées par tous les jeux de données. En particulier, la dynamique globale du réseau change en fonction de la période d’observation et le comportement de certains nÅ“uds diffère du comportement global du système.

Abdelhamid Salah Brahim

Jeudi 8 décembre 2011 à 10h30 – salle 25-26 / 105

On peut modéliser de nombreux objets issus du monde réel par des graphes. Ces objets sont issus de contextes très différents (ex. réseaux informatiques, sociaux ou biologiques), cependant ils se ressemblent au sens de certaines propriétées statistiques. On les désigne sous le terme général de graphes de terrain (complex networks en anglais) ou grands graphes d’interaction. L’analyse des graphes de terrain est probablement le plus grand champ de recherche du domaine et l’étude des phénomènes de diffusion constitue un des axes importants dans la compréhension de ces objets. Beaucoupde précédentes études ont été menées sur la diffusion avec une approche théorique mais avec l’apparition de données issues du monde réel de plus en plus riches, une approche empirique de l’analyse de ces réseaux est apparue comme une nécessité. La diffusion peut être de différentes natures: diffusion d’information, d’idées ou d’opinion. Cette diffusion est vue dans la plupart des travaux comme le résultat de l’interaction entre les éléments du réseau (i.e. les nÅ“uds du graphe). En complément de cette vision, nous considérons dans cette thèse que la diffusion, en plus de se produire entre les nÅ“uds, est aussi le résultat de l’interaction entre des groupes de nÅ“uds, appelés communautés, qui ont des propriétés en commun. On dit que le réseau possède une structure en communautés. Cette approche ouvre de nouvelles perspectives pour la compréhension et la caractérisation des graphes de terrain. L’objectif de cette thèse est d’étudier les phénomènes de diffusion de manière empirique non seulement à l’échelle des nÅ“ud mais à différents niveaux de la structure en communautés. A l’aide d’une approche statistique, nous proposons un ensemble de méthodes et de métriques pour aborder la diffusion sous un nouvel angle et aller plus loin dans la caractérisation de ces phénomènes .Nous nous proposons d’étudier les liens de diffusion au sein d’un réseau de blogs francophones. Nous montrons en premier lieu l’impact des communautés sur la popularité des blogs et distinguons des classes de comportement. Cela nous conduit à investiguer les interactions entre les communautés. Pour ce faire, nous définissons deux mesures: la distance communautaire et l’Homophilie. En dernier lieu, nous étudions la diffusion de proche on proche dans le graphe, caractérisée par des cascades de diffusion. Nous montrons que notre approche permet de détecter et d’interpréter les différents comportements de diffusion et de faire le lien entre les propriétés topologiques, temporelles et communautaires.

Xiaomin Wang

Mardi 13 décembre 2011 à 10h – salle 25-26 / 105

The degree distribution of the Internet topology is considered as one of its main properties. However, it is only known through a measurement procedure which gives a biased estimate. This measurement may in first approximation be modeled by a BFS (Breadth-First Search) tree. We explore here our ability to infer the type (Poisson or power-law) of the degree distribution from such a limited knowledge. We design procedures which estimate the degree distribution of a graph from a BFS or multi-BFS trees, and show experimentally (on models and real-world data) that our approaches succeed in making the difference between Poisson and power-law degree distribution and in some cases can also estimate the number of links. In addition, we establish a method, which is a diminishing urn, to analyze the procedure of the queue. We analyze the profile of the BFS tree from a random graph with a given degree distribution. The expected number of nodes and the expected number of invisible links at each level of BFS tree are two main results that we obtain. Using these informations, we propose two new methodologies to decide on the type of the underlying graph.

Olivier Lespinet

Jeudi 1er Décembre 2011, 11h, Amphi Herpin (bât. Esclangon)

Les champignons possèdent une très grande variété d’enzymes aux nombreuses applications potentielles. Nos travaux visent à étudier l’ensemble de cette diversité enzymatique afin de comprendre comment elle a pu prendre place et se maintenir au cours du temps. En utilisant des méthodes d’apprentissage et de fouille de données nous essayons également de voir dans quelle mesure la capacité enzymatique des champignons permet de rendre compte de leur évolution.

Bruno Pinaud

Jeudi 17 Novembre 2011, 11h, salle 25-26/105

Les systèmes de réécriture de graphes sont simples à expliquer : ils réalisent des modifications sur un graphe en remplaçant des sous-graphes sélectionnés au préalable sur la base de règles de transformations. Néanmoins, la combinaison des règles pour leur application transforme l’étude de ces systèmes en un problème complexe. A cause de cela, les experts de ces systèmes se satisfont bien souvent de représentations textuelles ou alors de dessins fait à la main pour représenter les règles de transformations. Au cours de cet exposé, je présenterai PORGY qui est un environnement visuel et interactif pour la réécriture de graphe. Cet environnement conçu avec des experts de réécritures de graphes qui avaient envie d’un véritable système interactif et visuel permet de construire, simuler et raisonner de façon visuelle et interactive sur le système complexe à étudier.

Telmo Menezes

Jeudi 17 Novembre 2011, 11h, salle 25-26/105

Complex networks are a powerful abstraction that fits a variety of phenomena across several scientific fields, including biology, sociology and economy. Analyzing and extracting insights from large complex networks is an ongoing goal of Complexity Science. In this presentation we present a novel approach based on evolutionary computation and genetic programming. Our method relies on using simple computer programs to represent network generative models, and then applying evolutionary search to find the best generators for observed networks. The final goal of this work is to be able to map large complex networks to plausible generators that have an high explanatory power. For this approach to be successful, a few obstacles have to be overcome. One of these is the measure of quality that guides evolutionary search, which has high overlap with another open problem in network theory: how to measure the distance between large networks with arbitrary sizes and topologies. We present our own solution to this problem using centrality metrics and a well known image recognition algorithm.

Thomas Aynaud

Jeudi 29 Septembre 2011, 11h, salle 26-00/101

Dans la plupart des graphes de terrain, il existe des groupes de noeuds fortement liés entre eux mais peu à l’extérieur, appelés des communautés et leur identification est importante dans de nombreux contextes pour décrire la structure du graphe. Nous étudierons la détection de ces communautés dans le cas de graphes dynamiques. Premièrement, nous détecterons des communautés à chaque instant, ce qui pose des problèmes de stabilité. Ensuite, nous définirons des communautés pertinentes sur une longue durée et proposerons une méthode pour trouver les durées intéressantes. Nous verrons enfin des applications à la détection d’événements et à la segmentation de vidéos.